RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	KRT85	P78386	507 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	NHLH1	Q02575	133 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR17	Q13304	367 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	PKP1	Q13835	747 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	SURF1	Q15526	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	IER5L	Q5T953	404 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	FGF14	Q92915	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	UBE4B	O95155	1302 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	SPTLC1	O15269	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	MICAL2	O94851	1124 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	CYP11A1	P05108	521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	EPHB3	P54753	998 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	TCHH	Q07283	1943 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RBBP4-215	ENST00000524393	TSC2	P49815	1807 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TNNC2	P02585	160 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ITGB3	P05106	788 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	KRT19	P08727	400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MYL4	P12829	197 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	AOC1	P19801	751 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	AFM	P43652	599 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PFKP	Q01813	784 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DUSP4	Q13115	394 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SHD	Q96IW2	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	HUS1	O60921	280 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ECI2	O75521	394 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	FGF19	O95750	216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CEBPB	P17676	345 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	RBP5	P82980	135 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	BFSP1	Q12934	665 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	BECN1	Q14457	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CEP72	Q9P209	647 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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