RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SMOQ99835 787 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 E9PLN8 166 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 GJB1P08034 283 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 VCAM1P19320 739 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 AKAP5P24588 427 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PRDX5P30044 214 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 HK3P52790 923 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 CACNA2D1P54289 1103 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 GPATCH3Q96I76 525 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PGBD1Q96JS3 809 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 TRIB1Q96RU8 372 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 WDCPQ9H6R7 721 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 GPR35Q9HC97 309 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC151A5D8V7 595 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 ANKRD62A6NC57 917 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 CHEK2O96017 543 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PTH2RP49190 550 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 NOGQ13253 232 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PTPRRQ15256 657 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SNX19Q92543 992 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 TOR1BO14657 336 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 IL33O95760 270 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 CD38P28907 300 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PIK3CGP48736 1102 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 KIF22Q14807 665 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC142Q17RM4 750 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 KAZNQ674X7 775 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SIK2Q9H0K1 926 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 MGST3O14880 152 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 IGLV2-14P01704 120 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 NEK2P51955 445 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 MC2RQ01718 297 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 TCF15Q12870 199 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 PGS1Q32NB8 556 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 LPIN2Q92539 896 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 RGMAQ96B86 450 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 FBXL20Q96IG2 436 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 FAM167AQ96KS9 214 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF785A8K8V0 405 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ORC4O43929 436 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 SOAT2O75908 522 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 RARBP10826 455 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 NPTX2P47972 431 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 NXPH1P58417 271 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 RSAD1Q9HA92 442 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ETAA1Q9NY74 926 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ABCF2Q9UG63 623 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MASP2O00187 686 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TRIAP1O43715 76 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TYRP14679 529 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 GRIA3P42263 894 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MAP2K6P52564 334 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ITIH3Q06033 890 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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