RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TPH2	Q8IWU9	490 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO19	Q96H55	970 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM20A	Q96MK3	541 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RGL1	Q9NZL6	768 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	FRYL	O94915	3013 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PRMT3	O60678	531 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRB5	O75023	590 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF4A	O95239	1232 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ADH6	P28332	368 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1D2	P34982	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MTAP	Q13126	283 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TUSC3	Q13454	348 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA7	Q15375	998 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NTRK3	Q16288	839 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NETO1	Q8TDF5	533 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	COL26A1	Q96A83	441 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	BRD9	Q9H8M2	597 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NID2	Q14112	1375 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1G	O43497	2377 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALT5	O43286	388 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ECI2	O75521	394 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	DEXI	O95424	95 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPS	Q13938	189 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	OCLN	Q16625	522 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT17	Q6IS24	598 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB39	O15060	712 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM12	O43184	909 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	LRG1	P02750	347 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TH	P07101	528 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMA5	P28066	241 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ELF1	P32519	619 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR3	P51677	355 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TYRO3	Q06418	890 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	DMWD	Q09019	674 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	GRM2	Q14416	872 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK8	Q86SG6	692 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NELL1	Q92832	810 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	DNASE1L2	Q92874	299 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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