RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 TBX21Q9UL17 535 aa11.49□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TFR2Q9UP52 801 aa11.49□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 HES2Q9Y543 173 aa11.49□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 IPPQ9Y573 584 aa11.49□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.49□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.49□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MYH10P35580 1976 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 XPOTO43592 962 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 GZMAP12544 262 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 P4HA1P13674 534 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PBX2P40425 430 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CDK7P50613 346 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CDR2Q01850 454 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PAK2Q13177 524 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 DSC3Q14574 896 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 LPIN1Q14693 890 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 RASIP1Q5U651 963 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 APOL6Q9BWW8 343 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 BCO2Q9BYV7 579 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PADI3Q9ULW8 664 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.48□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 FANCGO15287 622 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 RTN2O75298 545 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TACC1O75410 805 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CD4P01730 458 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MMEP08473 750 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 GHRP10912 638 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CKBP12277 381 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ITGA4P13612 1032 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP3A5P20815 502 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 AKAP5P24588 427 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CD52P31358 61 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ASPAP45381 313 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB27AP51159 221 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 GUCY2FP51841 1108 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF132P52740 706 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 GALCP54803 685 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 FMO1Q01740 532 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MYO1EQ12965 1108 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ADGRE1Q14246 886 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB30Q15771 203 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM240Q5SV17 173 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TAF3Q5VWG9 929 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM270Q6UE05 265 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM199Q8N511 208 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM58Q8NG06 486 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CAGE1Q8TC20 777 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 HPDLQ96IR7 371 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 NOX5Q96PH1 765 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ISCUQ9H1K1 167 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF39Q9H2S5 420 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MSRAQ9UJ68 235 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 POLIQ9UNA4 740 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CHD9Q3L8U1 2897 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MYO9BQ13459 2157 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 SCN1AP35498 2009 aa11.47□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 NCANO14594 1321 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CTAGE9A4FU28 777 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ANKRD62A6NC57 917 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF623O75123 536 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MOCS3O95396 460 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM253P0C7T8 217 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 SKIP12755 728 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CSF2RAP15509 400 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 IGFBP4P22692 258 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TERF1P54274 439 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms