RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CORO1BQ9BR76 489 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KCNH6Q9H252 994 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM206Q9H813 350 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CEP72Q9P209 647 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 RCOR1Q9UKL0 485 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CFAP45Q9UL16 551 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PTPRJQ12913 1337 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 FRYLO94915 3013 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MTMR11A4FU01 709 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KRBA1A5PL33 1030 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 OR6C75A6NL08 312 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 EXTL3O43909 919 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ITGB3P05106 788 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CYP11A1P05108 521 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SRFP11831 508 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PFKFB1P16118 471 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 NPR3P17342 541 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 AFMP43652 599 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TAF6P49848 677 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CDR1P51861 262 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 AMPD3Q01432 767 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CUL4BQ13620 913 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 UNC13DQ70J99 1090 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SIX5Q8N196 739 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GPD1LQ8N335 351 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 FLCNQ8NFG4 579 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CXorf38Q8TB03 319 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GPR152Q8TDT2 470 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 NXPE3Q969Y0 559 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 BORCS6Q96GS4 357 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KXD1Q9BQD3 176 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CA14Q9ULX7 337 aa8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1B0GVL5 298 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CYB561D2O14569 222 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TGFB1I1O43294 461 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KLRC4O43908 158 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MOSPD3O75425 235 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SOAT2O75908 522 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PTPN2P17706 415 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 FCARP24071 287 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 DUSP4Q13115 394 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GPR17Q13304 367 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MYBPC2Q14324 1141 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SV2CQ496J9 727 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 WSCD1Q658N2 575 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CENPPQ6IPU0 288 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MTSS1LQ765P7 747 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TMC8Q8IU68 726 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF560Q96MR9 790 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PHOX2BQ99453 314 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SIX4Q9UIU6 781 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MAFFQ9ULX9 164 aa8.94□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms