RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484897.3

RPSAP58-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 58, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP58, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP58-201ENST00000484897 MTMR3Q13615 1198 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 UVSSAQ2YD98 709 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SV2CQ496J9 727 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 KRBA2Q6ZNG9 492 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 HFE2Q6ZVN8 426 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 HS2ST1Q7LGA3 356 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 NT5DC4Q86YG4 428 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 OR5B17Q8NGF7 314 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ITFG1Q8TB96 612 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ING5Q8WYH8 240 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF560Q96MR9 790 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SORCS3Q9UPU3 1222 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 INSL5Q9Y5Q6 135 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 OR6C75A6NL08 312 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 KPNA7A9QM74 516 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF202O95125 648 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PAPLNO95428 1278 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 VNN2O95498 520 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TWF1Q12792 350 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 WSCD1Q658N2 575 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TPGS2Q68CL5 300 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 METTL23Q86XA0 190 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 OR10T2Q8NGX3 314 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CORO1BQ9BR76 489 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 KCNK12Q9HB15 430 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 INTS13Q9NVM9 706 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SIX4Q9UIU6 781 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 EXOC3O60645 756 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SOAT2O75908 522 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TNNC2P02585 160 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CYP11A1P05108 521 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 RHOP08100 348 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TNNI1P19237 187 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CYP24A1Q07973 514 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 DPYDQ12882 1025 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 DUSP4Q13115 394 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PSMD2Q13200 908 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ATAD1Q8NBU5 361 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 BORCS6Q96GS4 357 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 FNBP1Q96RU3 617 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 EPS15L1Q9UBC2 864 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 DSEQ9UL01 958 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 YIPF1Q9Y548 306 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 MTMR11A4FU01 709 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 MYL1P05976 194 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 LAMP2P13473 410 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CEBPBP17676 345 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PTPN2P17706 415 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PAX3P23760 479 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PNPLA4P41247 253 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CASP4P49662 377 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 RBP5P82980 135 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 GPR17Q13304 367 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PNOCQ13519 176 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TDGQ13569 410 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 MYBPC2Q14324 1141 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SURF1Q15526 300 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 WDR49Q8IV35 697 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ELMOD1Q8N336 334 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms