RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 TRIM9Q9C026 710 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CUEDC2Q9H467 287 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 TMEM206Q9H813 350 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 NOTCH4Q99466 2003 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 PAX3P23760 479 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ME1P48163 572 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 TAF6P49848 677 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CDR1P51861 262 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 DUSP4Q13115 394 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 IQCEQ6IPM2 695 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 FAM84AQ96KN4 292 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 GDE1Q9NZC3 331 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 YIPF1Q9Y548 306 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CYB561D2O14569 222 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CYP11A1P05108 521 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ASIC1P78348 528 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 AMPD3Q01432 767 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 MYBPC2Q14324 1141 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 BORCS6Q96GS4 357 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 MTMR11A4FU01 709 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ZNF197O14709 1029 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 EXTL3O43909 919 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 MYL4P12829 197 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 GJA1P17302 382 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 RFX1P22670 979 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CASP1P29466 404 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 HOXD13P35453 343 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 WSCD1Q658N2 575 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CENPPQ6IPU0 288 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 KPNA7A9QM74 516 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 MOSPD3O75425 235 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 SOAT2O75908 522 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 RESP18Q5W5W9 173 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ATL3Q6DD88 541 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 METTL23Q86XA0 190 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 GPD1LQ8N335 351 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ASAH2Q9NR71 780 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 DSEQ9UL01 958 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CFAP45Q9UL16 551 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ANK1P16157 1881 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ECI2O75521 394 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 MICAL2O94851 1124 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ITGB3P05106 788 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ALDH1A3P47895 512 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 EPHA5P54756 1037 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 SV2CQ496J9 727 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-211ENST00000482015 FCARP24071 287 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 AFMP43652 599 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 EPHB3P54753 998 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PLD1Q13393 1074 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 TEAD2Q15562 447 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms