RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 PAAF1Q9BRP4 392 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-208ENST00000481211 PRO3102Q9H379 93 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-208ENST00000481211 MARCH5Q9NX47 278 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-208ENST00000481211 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-208ENST00000481211 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-208ENST00000481211 MSRAQ9UJ68 235 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-208ENST00000481211 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-208ENST00000481211 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-208ENST00000481211 C5orf67F2Z3F1 127 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CYB561D2O14569 222 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SPTLC1O15269 473 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CAPN15O75808 1086 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 GYPCP04921 128 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 WARSP23381 471 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 BMPR1AP36894 532 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 LHX1P48742 406 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 KLK7P49862 253 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 GSDMDP57764 484 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 UBE3AQ05086 875 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 INCA1Q0VD86 236 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 LRMPQ12912 555 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 ARID5BQ14865 1188 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 TIGD5Q53EQ6 642 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 IQCEQ6IPM2 695 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SPOPLQ6IQ16 392 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CD300LGQ6UXG3 332 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 ARHGEF19Q8IW93 802 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 TATDN2Q93075 761 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 LZTS1Q9Y250 596 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 LINC01553A4QN01 128 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 EFEMP2O95967 443 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 LINC00271P0C7V0 271 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SCN1AP35498 2009 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 STAT1P42224 750 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 JAM2P57087 298 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 BPIFB4P59827 614 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CREMQ03060 361 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 RAPGEF1Q13905 1077 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SOWAHAQ2M3V2 549 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 RRAGAQ7L523 313 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 ADGRF2Q8IZF7 708 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 UBR7Q8N806 425 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 PDLIM2Q96JY6 352 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 KREMEN1Q96MU8 473 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CISHQ9NSE2 258 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 L1RE1Q9UN81 338 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 F8VZ95 297 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 H7C4K7 107 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 GABRDO14764 452 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 EPHB6O15197 1021 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 MFAP3LO75121 409 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 LRRN2O75325 713 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CILPO75339 1184 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 OAZ2O95190 189 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SOD2P04179 222 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 PAEPP09466 180 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 FERP16591 822 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 FGFR3P22607 806 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 PCSK1P29120 753 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 BRCC3P46736 316 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 ERVK-21P61565 698 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 USP41Q3LFD5 358 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 FAM71AQ8IYT1 594 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 BAP1Q92560 729 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 TNIP3Q96KP6 325 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 TTPALQ9BTX7 342 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SNX25Q9H3E2 840 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 SMYD3Q9H7B4 428 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 NLRC4Q9NPP4 1024 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 HCSTQ9UBK5 93 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 POLIQ9UNA4 740 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 LCHNA4D1U4 455 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 FGF18O76093 207 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 ITGB1P05556 798 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-208ENST00000481211 CA3P07451 260 aa13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms