RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481038.5

GPCPD1-205, Transcript of glycerophosphocholine phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPCPD1, Length 6,649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1-205ENST00000481038 MAML1Q92585 1016 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 BRF1Q92994 677 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 HMG20AQ9NP66 347 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ING3Q9NXR8 418 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 A0A0G2JND7 137 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SPOPO43791 374 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 TMEM127O75204 238 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ASMTLO95671 621 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MAPK4P31152 587 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ARPP19P56211 112 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 DSTNP60981 165 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 TRIM32Q13049 653 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 PON2Q15165 354 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 NFIL3Q16649 462 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 RNF220Q5VTB9 566 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ZNF425Q6IV72 752 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MICU3Q86XE3 530 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 PANX2Q96RD6 677 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 FNBP1Q96RU3 617 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MNTQ99583 582 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ALG1Q9BT22 464 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 RNF14Q9UBS8 474 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 TRIM24O15164 1050 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 PSTPIP1O43586 416 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 GABBR2O75899 941 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 BMP10O95393 424 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ZNF45Q02386 682 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ITGA9Q13797 1035 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SPIDRQ14159 915 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MORF4L2Q15014 288 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 RASA2Q15283 850 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MAPK11Q15759 364 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 CCDC157Q569K6 752 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SPERTQ8NA61 448 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 PMM1Q92871 262 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 KCNB2Q92953 911 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 MKL1Q969V6 931 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ARMT1Q9H993 441 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 FANCLQ9NW38 375 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ZNF221Q9UK13 617 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 C2orf81A6NN90 581 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SGK1O00141 431 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 KCNK3O14649 394 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ZW10O43264 779 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ZNF12P17014 697 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SFNP31947 248 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 EPHB1P54762 984 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 HLFQ16534 295 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 OCLNQ16625 522 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 AGAP11Q8TF27 550 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 TTC34A8MYJ7 566 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 SLC27A2O14975 620 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 CFLARO15519 480 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-205ENST00000481038 CPA1P15085 419 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms