RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 POLIQ9UNA4 740 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ODC1P11926 461 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 PON1P27169 355 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GLUD2P49448 558 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 FANCCQ00597 558 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 KCNMA1Q12791 1236 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 CETN1Q12798 172 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 PTPN14Q15678 1187 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GBP6Q6ZN66 633 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 BCO2Q9BYV7 579 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SDCBP2Q9H190 292 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SIX2Q9NPC8 291 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TLR9Q9NR96 1032 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 MYO9BQ13459 2157 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 OAZ2O95190 189 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TPM2P07951 284 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 IRS1P35568 1242 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 WSCD1Q658N2 575 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 DPH6Q7L8W6 267 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TATDN2Q93075 761 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TCF25Q9BQ70 676 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 IRAK3Q9Y616 596 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 GABRDO14764 452 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D4O60343 1298 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SLC9A1P19634 815 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TNNC1P63316 161 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 APBA1Q02410 837 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 APPL2Q8NEU8 664 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SPATA18Q8TC71 538 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 DSEQ9UL01 958 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 NME7Q9Y5B8 376 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 MYO7AQ13402 2215 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TEX33O43247 280 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 HUS1O60921 280 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TACC1O75410 805 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 URODP06132 367 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ADGRE1Q14246 886 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 NR1I3Q14994 352 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 WDR44Q5JSH3 913 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 OSTM1Q86WC4 334 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CEP57Q86XR8 500 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 NT5C1BQ96P26 610 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ARID3AQ99856 593 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SERPINC1P01008 464 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 FAM163BP0C2L3 166 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 P4HA1P13674 534 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 RAP1GAPP47736 663 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 UBXN1Q04323 297 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 LRMPQ12912 555 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 Q7L0L9 218 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TMC7Q7Z402 723 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 UBR7Q8N806 425 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 MMS19Q96T76 1030 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.36■■□□□ 1.01
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