RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 BORCS6Q96GS4 357 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ANTXRLA6NF34 631 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZNF197O14709 1029 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NFICP08651 508 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CPB1P15086 417 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ATF6P18850 670 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PRPHP41219 470 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 GPR17Q13304 367 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 KRT79Q5XKE5 535 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 TMEM150AQ86TG1 271 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 STKLD1Q8NE28 680 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 IRF7Q92985 503 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 KIF12Q96FN5 646 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 DRC1Q96MC2 740 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ASAH2Q9NR71 780 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PIRO00625 290 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 MAN2B1O00754 1011 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PIGRP01833 764 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CYP3A5P20815 502 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 LILRA4P59901 499 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CYP4F8P98187 520 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CCDC142Q17RM4 750 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 C8orf34Q49A92 452 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SPATA1Q5VX52 437 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 APPL2Q8NEU8 664 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SENP8Q96LD8 212 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 REEP2Q9BRK0 252 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 USP18Q9UMW8 372 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 TSC2P49815 1807 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SCN1AP35498 2009 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CHD6Q8TD26 2715 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 A0A0B4J269 797 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ANO9A1A5B4 782 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZNF263O14978 683 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CHADO15335 359 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NCAM2O15394 837 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CLDN3O15551 220 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 EXTL3O43909 919 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CLTAP09496 248 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CTHP32929 405 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 GPR15P49685 360 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZNF131P52739 623 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CCINQ13939 588 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 JADE1Q6IE81 842 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 IQCEQ6IPM2 695 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 HPS4Q9NQG7 708 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 TBX20Q9UMR3 447 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ANK1P16157 1881 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 TYMPP19971 482 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 GABRR2P28476 465 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CXCL12P48061 93 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ACOT2P49753 483 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CCR3P51677 355 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PON2Q15165 354 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 USP49Q70CQ1 688 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 GIPC2Q8TF65 315 aa11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms