RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	APPBP2	Q92624	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SLIT3	O75094	1523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	LRP6	O75581	1613 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	NFAT5	O94916	1531 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147		A0A1B0GTW7	788 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147		B2RBV5	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC26A4	O43511	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	TTC4	O95801	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	CHEK2	O96017	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	BDNF	P23560	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	CHKA	P35790	457 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	KRT2	P35908	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	FDFT1	P37268	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SCNN1D	P51172	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	NUP107	P57740	925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PTK2	Q05397	1052 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PRKG1	Q13976	671 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SEPT6	Q14141	434 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	MAPK6	Q16659	721 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	MED30	Q96HR3	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	MYH3	P11055	1940 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	DCC	P43146	1447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PODXL	O00592	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	ALOX15B	O15296	676 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67	3e-7	■■□□□ 12.9
RBMS1-208	ENST00000474147	CYP26A1	O43174	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	GPAA1	O43292	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	PRDM1	O75626	825 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS1-208	ENST00000474147	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms