RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469334.5

SMARCE1-207, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 2,128 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-207ENST00000469334 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 KRT35Q92764 455 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 THAP2Q9H0W7 228 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GCNT4Q9P109 453 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 FETUBQ9UGM5 382 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 COG5Q9UP83 839 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 LZTS1Q9Y250 596 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.51□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CAPN14A8MX76 684 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 POTECB2RU33 542 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 H3BRJ5 948 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
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SMARCE1-207ENST00000469334 RFX1P22670 979 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GCAP28676 217 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GNA11P29992 359 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 FDFT1P37268 417 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 FOLH1Q04609 750 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 ZBTB17Q13105 803 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GRM4Q14833 912 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 MAPK6Q16659 721 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 EFHC1Q5JVL4 640 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TMEM126BQ8IUX1 230 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 SGF29Q96ES7 293 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 MTMR9Q96QG7 549 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TBX22Q9Y458 520 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CACNA1SQ13698 1873 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 DCCP43146 1447 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TOM1O60784 492 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 KRT38O76015 456 aa9.5□□□□□ -0.89
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SMARCE1-207ENST00000469334 GSTT2BP0CG30 244 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 MAGEA4P43358 317 aa9.5□□□□□ -0.89
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SMARCE1-207ENST00000469334 HSPA13P48723 471 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CENPCQ03188 943 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 SNAPC2Q13487 334 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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SMARCE1-207ENST00000469334 SLC2A7Q6PXP3 512 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TMC7Q7Z402 723 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 DGKHQ86XP1 1220 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CCDC89Q8N998 374 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GIPC3Q8TF64 312 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 HAUS8Q9BT25 410 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 KCNK13Q9HB14 408 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 C6orf50Q9HD87 102 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.5□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 H3BNX3 289 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 TXNDC9O14530 226 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 PDE8AO60658 829 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 BAIAP3O94812 1187 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 FGFR1P11362 822 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 COMTP21964 271 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 MARCKSL1P49006 195 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 NCKAP1LP55160 1127 aa9.49□□□□□ -0.89
SMARCE1-207ENST00000469334 NAA20P61599 178 aa9.49□□□□□ -0.89
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