RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 TLE3Q04726 772 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 PRR16Q569H4 304 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM143Q96AN5 459 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 MED8Q96G25 268 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 MAFFQ9ULX9 164 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 MYLKQ15746 1914 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf3-211ENST00000463372 H7C4K7 107 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 I3L4J1 428 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 ASAP2O43150 1006 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 PLD1Q13393 1074 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 SERINC3Q13530 473 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CRY1Q16526 586 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 PKDCCQ504Y2 493 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 DEFB119Q8N690 84 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CD101Q93033 1021 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 FAM117AQ9C073 453 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 FBN2P35556 2912 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 PTGESO14684 152 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 GAS7O60861 476 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 STBD1O95210 358 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 FGF19O95750 216 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 WEE1P30291 646 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CYP4A11Q02928 519 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF33AQ06730 810 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC157Q569K6 752 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 TMC8Q8IU68 726 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 LRRC3Q9BY71 257 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PQD8 194 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 SMCO2A6NFE2 343 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 GJA4P35212 333 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 EPHB3P54753 998 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 SEC13P55735 322 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 PGBD3Q8N328 593 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 USP33Q8TEY7 942 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 TCP11Q8WWU5 503 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 RILPL2Q969X0 211 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 TBX20Q9UMR3 447 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 YIPF1Q9Y548 306 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 KNL1Q8NG31 2342 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 ARSAP15289 507 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 BRCC3P46736 316 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CLCNKBP51801 687 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 PTENP60484 403 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 KCNH2Q12809 1159 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 NAB2Q15742 525 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 ANO5Q75V66 913 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 GAREM2Q75VX8 874 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 FERMT3Q86UX7 667 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CPA6Q8N4T0 437 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 RDM1Q8NG50 284 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 FGF11Q92914 225 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf3-211ENST00000463372 RIT2Q99578 217 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms