RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 MTMR3Q13615 1198 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 RDH13Q8NBN7 331 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 FAM84AQ96KN4 292 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 DSEQ9UL01 958 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 MAFFQ9ULX9 164 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 TECTAO75443 2155 aa25.87■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 KPNA7A9QM74 516 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 CYP11A1P05108 521 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 OR4Q2P0C623 313 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 PRR29P0C7W0 189 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 COL9A1P20849 921 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 METTL23Q86XA0 190 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 INTS13Q9NVM9 706 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 EPS15L1Q9UBC2 864 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 INSL5Q9Y5Q6 135 aa25.86■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM221A6NGB7 291 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 M0R296 226 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 KRT19P08727 400 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 RBP5P82980 135 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 MYBPC2Q14324 1141 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 UBALD2Q8IYN6 164 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 BORCS6Q96GS4 357 aa25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 TNNC2P02585 160 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 GPR17Q13304 367 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 WSCD1Q658N2 575 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 KCNK12Q9HB15 430 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 IGSF9Q9P2J2 1179 aa25.84■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 DOCK8Q8NF50 2099 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 LAMP2P13473 410 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 DPYDQ12882 1025 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 BFSP1Q12934 665 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 WDR49Q8IV35 697 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 CXorf38Q8TB03 319 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 SIX4Q9UIU6 781 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRJQ12913 1337 aa25.83■■□□□ 1.73
SMKR1-201ENST00000462322 EXOC3O60645 756 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 PTPN2P17706 415 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 CYP24A1Q07973 514 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 ELMOD1Q8N336 334 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 ITFG1Q8TB96 612 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 FNBP1Q96RU3 617 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM209Q96SK2 561 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 CDH7Q9ULB5 785 aa25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 RHOBTB3O94955 611 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 RHOP08100 348 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 TNNI1P19237 187 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 TWF1Q12792 350 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 TDGQ13569 410 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 PSMD6Q15008 389 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 PBXIP1Q96AQ6 731 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 CORO1BQ9BR76 489 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 TSC2P49815 1807 aa25.81■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 HUS1O60921 280 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 KIF20AO95235 890 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 VNN2O95498 520 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP4Q13115 394 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 IQCEQ6IPM2 695 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 RSAD2Q8WXG1 361 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 FGF13Q92913 245 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 ASIC4Q96FT7 647 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 CGRRF1Q99675 332 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 RTP3Q9BQQ7 232 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.8■■□□□ 1.72
SMKR1-201ENST00000462322 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms