RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447698.5

STRADB-204, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene STRADB, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-204ENST00000447698 KPNA7A9QM74 516 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 XYLBO75191 536 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 ASGR2P07307 311 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 KRT19P08727 400 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 CYP24A1Q07973 514 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 ADCY1Q08828 1119 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 SURF1Q15526 300 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 SV2CQ496J9 727 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 TPGS2Q68CL5 300 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 TCEAL8Q8IYN2 117 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 ZNF560Q96MR9 790 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 MYADMQ96S97 322 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 TMEM209Q96SK2 561 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.18■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 OR6C75A6NL08 312 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 EXOC3O60645 756 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 CYP11A1P05108 521 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 BFSP1Q12934 665 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 PNOCQ13519 176 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 WSCD1Q658N2 575 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.17■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 ARHGEF37A1IGU5 675 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 GPR37L1O60883 481 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 VNN2O95498 520 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 PNPLA4P41247 253 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 RBP5P82980 135 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 ZXDAP98168 799 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 PSMD6Q15008 389 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 PTPN21Q16825 1174 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 RTL10Q7L3V2 364 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 LRFN3Q9BTN0 628 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 DSEQ9UL01 958 aa25.16■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 TNNC2P02585 160 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 LRG1P02750 347 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 FSHRP23945 695 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 CDR1P51861 262 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 KCNB1Q14721 858 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 METTL23Q86XA0 190 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 WDR49Q8IV35 697 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 EDAQ92838 391 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 FNBP1Q96RU3 617 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 CGRRF1Q99675 332 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 RTP3Q9BQQ7 232 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 DMAC2Q9NW81 257 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 INSL5Q9Y5Q6 135 aa25.15■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 PDXKO00764 312 aa25.14■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 POU2F2P09086 479 aa25.14■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 TNNI1P19237 187 aa25.14■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 GPR17Q13304 367 aa25.14■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 MYBPC2Q14324 1141 aa25.14■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.14■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.14■■□□□ 1.62
STRADB-204ENST00000447698 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 NR3C1P04150 777 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 CASP4P49662 377 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 ITFG1Q8TB96 612 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 ZNF516Q92618 1163 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 CRISPLD1Q9H336 500 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 L1RE1Q9UN81 338 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.13■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 TWF1Q12792 350 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 DUSP4Q13115 394 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 HPDLQ96IR7 371 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 EPS15L1Q9UBC2 864 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 MAFFQ9ULX9 164 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.12■■□□□ 1.61
STRADB-204ENST00000447698 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms