RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.35□□□□□ -0.11
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RABGEF1-210ENST00000437078 MAFGO15525 162 aa14.35□□□□□ -0.11
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RABGEF1-210ENST00000437078 CCL15Q16663 113 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 NLRP14Q86W24 1093 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.35□□□□□ -0.11
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RABGEF1-210ENST00000437078 ARMCX2Q7L311 632 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-210ENST00000437078 TMC2Q8TDI7 906 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-210ENST00000437078 MED10Q9BTT4 135 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-210ENST00000437078 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC78A2IDD5 438 aa14.32□□□□□ -0.12
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