RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3B-206ENST00000436282 CCDC6Q16204 474 aa15.76■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.76■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.76■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.76■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.76■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 RIT2Q99578 217 aa15.76■□□□□ 0.11
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