RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT19P08727 400 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 EMC10Q5UCC4 262 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATG4AQ8WYN0 398 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 VTA1Q9NP79 307 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 A6NNZ2 444 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPR25O00155 361 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 LSM8O95777 96 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFFO1Q0D2I5 559 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TUBB8Q3ZCM7 444 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM35BQ8NCS4 154 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 AFG1LQ8WV93 481 aa26.83■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GLTPD2A6NH11 291 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPFIA4O75335 1185 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL18RAPO95256 599 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CALB1P05937 261 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF286BP0CG31 522 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 GJC1P36383 396 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLCO2A1Q92959 643 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 HEMGNQ9BXL5 484 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 IP6K2Q9UHH9 426 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 POLIQ9UNA4 740 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 AKT3Q9Y243 479 aa26.82■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 RALAP11233 206 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 HPDP32754 393 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADCYAP1R1P41586 468 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT17Q04695 432 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPTC7Q8NI37 304 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 TFAP2BQ92481 460 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ART4Q93070 314 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPB41L4BQ9H329 900 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 SKIDA1Q1XH10 827 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT71Q3SY84 523 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 KATNAL2Q8IYT4 538 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANK1P16157 1881 aa26.81■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 BTBD19C9JJ37 291 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAGEB2O15479 319 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 NFICP08651 508 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CETPP11597 493 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAN1A1P33908 653 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 POU5F1BQ06416 359 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCLK3Q9C098 648 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLXNB2O15031 1838 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 MGAMO43451 1857 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM191CA6NGB0 347 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 LACTBL1A8MY62 500 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 VTNP04004 478 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 STAG3L1P0CL83 205 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAP1GAPP47736 663 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 GUCY1A3Q02108 690 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 AMHR2Q16671 573 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM187BQ17R55 369 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 DNAJC24Q6P3W2 148 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPB2Q96IY4 423 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 RABEP2Q9H5N1 569 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 SIX4Q9UIU6 781 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CALCOCO2Q13137 446 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCL15Q16663 113 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 AGBL2Q5U5Z8 902 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 DENND2CQ68D51 928 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 BCAS4Q8TDM0 211 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCEEQ96PE7 176 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.79■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZEB2O60315 1214 aa26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 SHBGP04278 402 aa26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUDT17P0C025 328 aa26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCF2P10911 925 aa26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 WDR72Q3MJ13 1102 aa26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF667Q5HYK9 610 aa26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXD1Q8NHP7 514 aa26.78■■□□□ 1.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
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