RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CPLX3Q8WVH0 158 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 JAKMIP2Q96AA8 810 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM169Q96HH4 297 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GDF15Q99988 308 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 XYLT2Q9H1B5 865 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NLRC4Q9NPP4 1024 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAJC12Q9UKB3 198 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYO6Q9UM54 1294 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FHOD1Q9Y613 1164 aa10.99□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIP11Q15643 1979 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYB561D2O14569 222 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NRP1O14786 923 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BMP8BP34820 402 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP8P40818 1118 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STAT1P42224 750 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC11A1P49279 550 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBED6P86452 979 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT17Q04695 432 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB30Q15771 203 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IQCEQ6IPM2 695 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RRAGAQ7L523 313 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DPH6Q7L8W6 267 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGEF19Q8IW93 802 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADGRF2Q8IZF7 708 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TDHQ8IZJ6 230 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM86AQ8N2M4 240 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TOP6BLQ8N6T0 577 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LMO3Q8TAP4 145 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HASPINQ8TF76 798 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STK33Q9BYT3 514 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GANQ9H2C0 597 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNX25Q9H3E2 840 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SIX2Q9NPC8 291 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPG21Q9NZD8 308 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MSRAQ9UJ68 235 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAPN11Q9UMQ6 739 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COL4A6Q14031 1691 aa10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPEF2O14830 753 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRN2O75325 713 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GYPCP04921 128 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GALTP07902 379 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD58P19256 250 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CASP14P31944 242 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTNNB1P35222 781 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT9P35527 623 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASPAP45381 313 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BPIFB4P59827 614 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASIC2Q16515 512 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SFMBT2Q5VUG0 894 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CXorf38Q8TB03 319 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPATA18Q8TC71 538 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RABGGTAQ92696 567 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TATDN2Q93075 761 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SUSD3Q96L08 255 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SENP8Q96LD8 212 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAAF1Q9BRP4 392 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BCO2Q9BYV7 579 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CWH43Q9H720 699 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMYD3Q9H7B4 428 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CACNG4Q9UBN1 327 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POLIQ9UNA4 740 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa10.97□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 F8VZ95 297 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYN3O14994 580 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPHB6O15197 1021 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MFAP3LO75121 409 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TACC1O75410 805 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NOL4O94818 638 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM163BP0C2L3 166 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FERP16591 822 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TYMPP19971 482 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCSK1P29120 753 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SOX5P35711 763 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LHX1P48742 406 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDE6CP51160 858 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APBA1Q02410 837 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA1841Q6NSI8 718 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FUT10Q6P4F1 479 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDXDC1Q6P996 788 aa10.96□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GJB7Q6PEY0 223 aa10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms