RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAN1A1P33908 653 aa19.88■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHKA2P46019 1235 aa19.88■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PMS2P54278 862 aa19.88■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDCLQ13371 301 aa19.88■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa19.88■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VTA1Q9NP79 307 aa19.88■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL18RAPO95256 599 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CALB1P05937 261 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU5F1BQ06416 359 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R7Q15435 360 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ART4Q93070 314 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST7Q9NS84 486 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR25O00155 361 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDHXO00330 501 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM187BQ17R55 369 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC50Q8IVM0 306 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KATNAL2Q8IYT4 538 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC01465Q8N7H1 131 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM35BQ8NCS4 154 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPTC7Q8NI37 304 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG4AQ8WYN0 398 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TFAP2BQ92481 460 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IP6K2Q9UHH9 426 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USTQ9Y2C2 406 aa19.87■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLTPD2A6NH11 291 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDT17P0C025 328 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RALAP11233 206 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT17Q04695 432 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX1Q13596 522 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGBL2Q5U5Z8 902 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMYD5Q6GMV2 418 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AFG1LQ8WV93 481 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM129AQ9BZQ8 928 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGC3Q9UN70 934 aa19.86■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087WZ62 844 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM191CA6NGB0 347 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB2O15479 319 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF286BP0CG31 522 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMHR2Q16671 573 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT71Q3SY84 523 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCLK3Q9C098 648 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIX4Q9UIU6 781 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLIQ9UNA4 740 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFICP08651 508 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT19P08727 400 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HPDP32754 393 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADCYAP1R1P41586 468 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GUCY1A3Q02108 690 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFFO1Q0D2I5 559 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDTC1Q8N5D0 677 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXD1Q8NHP7 514 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R16BQ96T49 567 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEMGNQ9BXL5 484 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KATNBL1Q9H079 304 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF408Q9H9D4 720 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa19.85■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTBD19C9JJ37 291 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAG3L1P0CL83 205 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCF2P10911 925 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CETPP11597 493 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSR1P43307 286 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC24Q6P3W2 148 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf127Q8N9H9 656 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCEEQ96PE7 176 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C16orf70Q9BSU1 422 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKT3Q9Y243 479 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL1A2P08123 1366 aa19.84■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJC1P36383 396 aa19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CALCOCO2Q13137 446 aa19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF667Q5HYK9 610 aa19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DENND2CQ68D51 928 aa19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCO2Q9BYV7 579 aa19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms