RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 ALS2CLQ60I27 953 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 PPM1KQ8N3J5 372 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 USP38Q8NB14 1042 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 HELQQ8TDG4 1101 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 KREMEN1Q96MU8 473 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 SPAG5Q96R06 1193 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 SIX4Q9UIU6 781 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 YARSP54577 528 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 LPPQ93052 612 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 ADAM2Q99965 735 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 GGA2Q9UJY4 613 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 TANC1Q9C0D5 1861 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 TLR3O15455 904 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 TNNC2P02585 160 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 MYL6P60660 151 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 ARID5AQ03989 594 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 CXorf38Q8TB03 319 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 KIF12Q96FN5 646 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 NT5C1BQ96P26 610 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 C11orf49Q9H6J7 331 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 CHUKO15111 745 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 LRRC26Q2I0M4 334 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 MMGT1Q8N4V1 131 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 STK33Q9BYT3 514 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 CNTN3Q9P232 1028 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTU1-201ENST00000421832 TMCO5BA8MYB1 307 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 DCDC2CA8MYV0 355 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 F8VZ95 297 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 PITPNM1O00562 1244 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 SFMBT2Q5VUG0 894 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 HGSNATQ68CP4 663 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 SCLYQ96I15 445 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 TOX2Q96NM4 488 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 GUCA1BQ9UMX6 200 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 C2CD2Q9Y426 696 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 NUB1Q9Y5A7 615 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ITGB3P05106 788 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 KRT83P78385 493 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 CD302Q8IX05 232 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 OTUD6BQ8N6M0 293 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ZFP42Q96MM3 310 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 HIPK3Q9H422 1215 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 CAPN7Q9Y6W3 813 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 WNT8AQ9H1J5 351 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 AIPL1Q9NZN9 384 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 SCN1AP35498 2009 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ASS1P00966 412 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 KRT19P08727 400 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 CCL23P55773 120 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ZBTB6Q15916 424 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 XKR4Q5GH76 650 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 EMC10Q5UCC4 262 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 CYP2C18P33260 490 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 TRPC3Q13507 836 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 WDR44Q5JSH3 913 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 DPP3Q9NY33 737 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 GFPT2O94808 682 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 RFX1P22670 979 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 TCTN1Q2MV58 587 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 RNF169Q8NCN4 708 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 JAKMIP2Q96AA8 810 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 TBX21Q9UL17 535 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 A0A0U1RQF3 1178 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU1-201ENST00000421832 PTGESO14684 152 aa26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms