RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 SNX17Q15036 470 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PALLDQ8WX93 1383 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 H7C0C1 242 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PIK3CDO00329 1044 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RTN2O75298 545 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 USP1O94782 785 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 IFNA8P32881 189 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ATP5OP48047 213 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TFR2Q9UP52 801 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 AGPSO00116 658 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 AIM2O14862 343 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CDK16Q00536 496 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 NUP93Q8N1F7 819 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 E2F7Q96AV8 911 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 VPS45Q9NRW7 570 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 A8MUI8 341 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ANGPT2O15123 496 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 FOXO3O43524 673 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 LINGO3P0C6S8 592 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CLCN2P51788 898 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CENPCQ03188 943 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 AIFM3Q96NN9 605 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 MARCH7Q9H992 704 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 MPP6Q9NZW5 540 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 UTYO14607 1347 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 NBNO60934 754 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ALDH1A3P47895 512 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 IGBP1P78318 339 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 DEPDC5O75140 1603 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 M0QX08 132 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CCNB1P14635 433 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 VCLP18206 1134 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TAC1P20366 129 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ANGPT1Q15389 498 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PLK2Q9NYY3 685 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SUN2Q9UH99 717 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CDYLQ9Y232 598 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 WDR64B1ANS9 1081 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 BTN3A3O00478 584 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 NDUFB5O43674 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CIAO1O76071 339 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ITGA8P53708 1063 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PTK7Q13308 1070 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PLS1Q14651 629 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 MEA1Q16626 185 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ANO7Q6IWH7 933 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ACEP12821 1306 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 THRAP10827 490 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF6Q15052 776 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SLC15A2Q16348 729 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RFX6Q8HWS3 928 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 DCLK3Q9C098 648 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms