RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALML6Q8TD86 181 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBF1Q8TES7 1133 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 OIT3Q8WWZ8 545 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 LPIN2Q92539 896 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXN4Q96NZ1 517 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUX5Q96PT3 197 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ORAI2Q96SN7 254 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAUS7Q99871 368 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP26B1Q9NR63 512 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLC4Q9NSK0 619 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM86C1Q9NVL1 165 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIC8BQ9NVN3 520 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 UTS2RQ9UKP6 389 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 DTX4Q9Y2E6 619 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMX3A6NHT5 357 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A27PA6NNH2 459 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTIFO43310 598 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT6AP02538 564 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMBPP02760 352 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT6BP04259 564 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNAT1P11488 350 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCP1P13796 627 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDKN1AP38936 164 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT6CP48668 564 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLCN5P51795 746 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANTXR2P58335 489 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPATQ06203 517 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP4F3Q08477 520 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABHD17CQ6PCB6 329 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZR54 194 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALNT4Q8N4A0 578 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGFBP3Q8TAT2 258 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMC1Q8TDI8 760 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC3Q9BY71 257 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD244Q9BZW8 370 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM15Q9C019 465 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRMS1Q9HCU9 246 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHST11Q9NPF2 352 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERTAD4Q9NUC0 356 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO6Q9UM54 1294 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCF19Q9Y242 345 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC6A5Q9Y345 797 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0J9YWU9 116 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRAMEF25A6NGN4 478 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 VWC2LB2RUY7 222 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 H7C1Q1 480 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 LATO43561 262 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNH1O95259 989 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARIH2O95376 493 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 PF4P02776 101 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLKB1P03952 638 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 A1BGP04217 495 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXC6P09630 235 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM163BP0C2L3 166 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR2F6P10588 404 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTSAP10619 480 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLD2P49005 469 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 NXPH1P58417 271 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS13P62277 151 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEFQ10587 303 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTF2H3Q13889 308 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKS6Q68DC2 871 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTLL5Q6EMB2 1281 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 POMZP3Q6PJE2 187 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABHD15Q6UXT9 468 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFX8Q6ZV50 586 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO33Q7Z6M2 555 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF440Q8IYI8 595 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLGN4XQ8N0W4 816 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARP8Q8N3A8 854 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO27Q8NI29 283 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFKQ969G6 155 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 EBF4Q9BQW3 602 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALG8Q9BVK2 526 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMP28Q9H239 520 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-172P-201ENST00000411000 KANSL2Q9H9L4 492 aa-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms