RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPME1Q9Y570 386 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOBPA7XYQ1 873 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEXIO95424 95 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC192P0DO97 292 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATF6P18850 670 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOXA6P31267 233 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNR2P34972 360 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CREB5Q02930 508 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MESP2Q0VG99 397 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCRN1Q12765 414 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUSP4Q13115 394 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC32Q14392 662 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC142Q17RM4 750 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CTXN3Q4LDR2 81 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 XKR4Q5GH76 650 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF20Q5VTR2 975 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 OTUD6AQ7L8S5 288 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HACE1Q8IYU2 909 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 BEST2Q8NFU1 509 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDX12PQ92771 950 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D32Q96NH3 1257 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 EBF3Q9H4W6 596 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASAH2Q9NR71 780 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKEF1Q9NU02 776 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL12A1Q99715 3063 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTMR11A4FU01 709 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACKR2O00590 384 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF197O14709 1029 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TADA3O75528 432 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MICAL2O94851 1124 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 LARGE1O95461 756 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CPB1P15086 417 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP2B1P20020 1258 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GABRR2P28476 465 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELF1P32519 619 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MCM4P33991 863 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TXKP42681 527 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR15P49685 360 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 IRX4P78413 519 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP2R5DQ14738 602 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR158Q5T848 1215 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDXDC1Q6P996 788 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CATSPER3Q86XQ3 398 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DAW1Q8N136 415 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXL16Q8N461 479 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 LOXL4Q96JB6 756 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUSD3Q96L08 255 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRIMPOLQ96LW4 560 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTMR9Q96QG7 549 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 VPS45Q9NRW7 570 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYN3O14994 580 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAVIN2O95810 425 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRB1P04280 392 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms