RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ITIH3Q06033 890 aa16.56■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.54■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 CLSTN1O94985 981 aa16.53■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.53■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.53■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 TAF4BQ92750 862 aa16.53■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.53■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.53■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.53■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAM12O43184 909 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MBTPS2O43462 519 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA31D3P0C874 917 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 P4HA1P13674 534 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CPB1P15086 417 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MTHFRP42898 656 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 LHX1P48742 406 aa16.52■□□□□ 0.24
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