RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364872.1

RNU6-563P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 563, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-563P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-563P-201ENST00000364872 PPATQ06203 517 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 MOGSQ13724 837 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 KRT32Q14532 448 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 SKIDA1Q1XH10 827 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 KIF19Q2TAC6 998 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZNF750Q32MQ0 723 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 WDR72Q3MJ13 1102 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 TPRNQ4KMQ1 711 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ATAT1Q5SQI0 421 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 PHF19Q5T6S3 580 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 SEL1L3Q68CR1 1132 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 SLC6A19Q695T7 634 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 SPATA8Q6RVD6 105 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 MFSD7Q6UXD7 560 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZNF804AQ7Z570 1209 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 PPM1NQ8N819 430 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 Q8N9L7 120 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 CNBD1Q8NA66 436 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 TTC16Q8NEE8 873 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 IL31RAQ8NI17 732 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 NEK9Q8TD19 979 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 EPS8L1Q8TE68 723 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 SSC4DQ8WTU2 575 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 OIT3Q8WWZ8 545 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 DHX58Q96C10 678 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 LGALS12Q96DT0 336 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZDHHC15Q96MV8 337 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 PKP4Q99569 1192 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 POFUT1Q9H488 388 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZNF576Q9H609 170 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 WDR70Q9NW82 654 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 TMEM63CQ9P1W3 806 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 CNTN3Q9P232 1028 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 CTSZQ9UBR2 303 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 IL17BQ9UHF5 180 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 CLCA2Q9UQC9 943 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RAD54BQ9Y620 910 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 MYO10Q9HD67 2058 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 UMODL1Q5DID0 1318 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZNF292O60281 2723 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 LINC00473A8K010 186 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 PER2O15055 1255 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 YY2O15391 372 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 TLR2O60603 784 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 SLC22A3O75751 556 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 PRAMEF1O95521 474 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 TTLL1O95922 423 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 C9P02748 559 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 PRSS2P07478 247 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ITGA2BP08514 1039 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RPS2P15880 293 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 TSHRP16473 764 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 KLK2P20151 261 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 THBS4P35443 961 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 P2RX3P56373 397 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RIPK4P57078 832 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 RNF4P78317 190 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 NDPQ00604 133 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 IL9RQ01113 521 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 LRRC63Q05C16 580 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ARL16Q0P5N6 197 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 KIF5AQ12840 1032 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 GEN1Q17RS7 908 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ZNF876PQ49A33 203 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 ACCSLQ4AC99 568 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 FSTL4Q6MZW2 842 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 IGFL2Q6UWQ7 119 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 USP53Q70EK8 1073 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-563P-201ENST00000364872 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms