RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR2E3Q9Y5X4 410 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAST3O60307 1309 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 E9PLN8 166 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MATN4O95460 622 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESRRBO95718 433 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNAI2P04899 355 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH2P05091 517 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 RARBP10826 455 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHKA1P46020 1223 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MC2RQ01718 297 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL10A1Q03692 680 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 FPGSQ05932 587 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXI1Q12951 378 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF22Q14807 665 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZNX1 250 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPH2Q8IWU9 490 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 LNX2Q8N448 690 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX19Q92543 992 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35A4Q96G79 324 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRGUKQ96M69 825 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNPPD1Q9BV87 410 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIK2Q9H0K1 926 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS13Q9NVM9 706 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNPOQ9NVS9 261 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD5Q9NXV2 234 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 DMTF1Q9Y222 760 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BUI4 141 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP1G1O43747 822 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFPL1O75677 317 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUN1O94901 812 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 AHSGP02765 367 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPA6P17066 643 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TYRP1P17643 537 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYRK1AQ13627 763 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLS1Q14651 629 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR150Q8NGU9 434 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9A6Q92581 669 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CGRRF1Q99675 332 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 E7ENX8 843 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0QYG6 137 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMP5P22003 454 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPLP40238 635 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPTX2P47972 431 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB1AP62820 205 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAP2Q03519 686 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTF2H3Q13889 308 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND1CQ8IV53 801 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHDC4Q8TBB5 520 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 JDP2Q8WYK2 163 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZG16BQ96DA0 208 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETAA1Q9NY74 926 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BML4 177 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-552P-201ENST00000362869 YY2O15391 372 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROM1O43490 865 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEX1O43933 1283 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS4BO75351 444 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF20AO95235 890 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCGB1D2O95969 90 aa3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms