RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 GID8Q9NWU2 228 aa11.39□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.39□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7EPI3 171 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAF5O00463 557 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 STRNO43815 780 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TLR2O60603 784 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLPTM1O96005 669 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 AGTP01019 485 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF132P52740 706 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PAOXQ6QHF9 649 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 RASSF3Q86WH2 238 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYH11P35749 1972 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 A8MU76 341 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 AP3B1O00203 1094 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 KCNK3O14649 394 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 AMPD1P23109 780 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 CALCRLQ16602 461 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 BAP1Q92560 729 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 DCCP43146 1447 aa11.38□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYH4Q9Y623 1939 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR91A4D1P6 747 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM114B3SHH9 223 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRT75O95678 551 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHKAP35790 457 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP4CP60510 307 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PICALMQ13492 652 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 NFIXQ14938 502 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PHKG1Q16816 387 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 MCUR1Q96AQ8 359 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 EYA3Q99504 573 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 E9PMD0 336 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGAP33O14559 1287 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDC80O14777 642 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAPK13O15264 365 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 EXOC3O60645 756 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRPA1O75762 1119 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 CES1P23141 567 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ETFBP38117 255 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACADSBP45954 432 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDXDC1Q6P996 788 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 NATD1Q8N6N6 113 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDZD8Q8NEN9 1154 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP95Q96GE4 821 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 CASZ1Q86V15 1759 aa11.37□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087X0T9 212 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BSA7 217 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM228BP0C875 321 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 STX2P32856 288 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 MTFR1Q15390 333 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAN2A1Q16706 1144 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 HGSNATQ68CP4 663 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 UNC13DQ70J99 1090 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 EXD1Q8NHP7 514 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.36□□□□□ -0.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 RRN3Q9NYV6 651 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms