RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 GPD1P21695 349 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CPT1AP50416 773 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CASP4P49662 377 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 IL31Q6EBC2 164 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 NOTUMQ6P988 496 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 USP38Q8NB14 1042 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DYRK4Q9NR20 520 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 YAF2Q8IY57 180 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CYBBP04839 570 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 KLRC1P26715 233 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 EHD2Q9NZN4 543 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 AGLP35573 1532 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ITIH2P19823 946 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 MUC3BQ9H195 1237 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ALG6Q9Y672 507 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DPP3Q9NY33 737 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SPATA21Q7Z572 469 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 THAP2Q9H0W7 228 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CASS4Q9NQ75 786 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PRRG1O14668 218 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 WDR93Q6P2C0 686 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TTC23LQ6PF05 361 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 JAMLQ86YT9 394 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SGPL1O95470 568 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TSC22D3Q99576 134 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ISCUQ9H1K1 167 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PXDNQ92626 1479 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PDHA1P08559 390 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 KCNA2P16389 499 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 KCNJ1P48048 391 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SPATA18Q8TC71 538 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TMCC1O94876 653 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 RDM1Q8NG50 284 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 STOML1Q9UBI4 398 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 P4HA2O15460 535 aa22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 PON1P27169 355 aa22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CUL3Q13618 768 aa22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 TLR2O60603 784 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CUL2Q13617 745 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 ETFBP38117 255 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 NCAM1P13591 858 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 GFAPP14136 432 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 BACE1P56817 501 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CPB2Q96IY4 423 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 ACADSBP45954 432 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CST8O60676 142 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CORO7P57737 925 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.07■■□□□ 1.12
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