RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ZSCAN32Q9NX65 697 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 PIAS3Q9Y6X2 628 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 FGF19O95750 216 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 VIPR2P41587 438 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 EPHA5P54756 1037 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 VEPH1Q14D04 833 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 SPATA1Q5VX52 437 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ADALQ6DHV7 355 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 VITQ6UXI7 678 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 MFSD6LQ8IWD5 586 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 FAM3CQ92520 227 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 KCNN1Q92952 543 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 SENP8Q96LD8 212 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 GCNAQ96QF7 691 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 DSEQ9UL01 958 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ASB3Q9Y575 518 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 A0A0B4J269 797 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 A0A1W2PRU2 124 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 TXLNAP40222 546 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF131P52739 623 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 LILRA4P59901 499 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 SHKBP1Q8TBC3 707 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ZSWIM3Q96MP5 696 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 IER2Q9BTL4 223 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 DERAQ9Y315 318 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 HEPACAM2A8MVW5 462 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 NRLP54845 237 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM130Q8N3G9 435 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ATXN3LQ9H3M9 355 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 TRPV4Q9HBA0 871 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 TRPV5Q9NQA5 729 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 RAB23Q9ULC3 237 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 CEP250Q9BV73 2442 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 PDCP20941 246 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ACOT2P49753 483 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 MTAPQ13126 283 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 CENPPQ6IPU0 288 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 MSANTD3Q96H12 275 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ASB7Q9H672 318 aa25.24■■□□□ 1.63
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TMEM54-201ENST00000329151 FRYLO94915 3013 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 MTMR11A4FU01 709 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 NFICP08651 508 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 TUFMP49411 452 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 GTF2BQ00403 316 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 LRRC32Q14392 662 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 POTEHQ6S545 545 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 TSSK4Q6SA08 328 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 DCLK2Q8N568 766 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 POMGNT1Q8WZA1 660 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 LMAN1LQ9HAT1 526 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 SCN1AP35498 2009 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 PPEF2O14830 753 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 FAM189A1O60320 539 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 MOSPD3O75425 235 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 DDIT3P35638 169 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 TAF6P49848 677 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 CCR3P51677 355 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 POSTNQ15063 836 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 PSMG2Q969U7 264 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 CHRDQ9H2X0 955 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 C2CD2Q9Y426 696 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 GPR179Q6PRD1 2367 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ADRB2P07550 413 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 CCNE1P24864 410 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 GABRR2P28476 465 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TMEM54-201ENST00000329151 GPR158Q5T848 1215 aa25.21■■□□□ 1.63
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