RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318121.7

CLSPN-202, Transcript of claspin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSPN, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPN-202ENST00000318121 LILRA4P59901 499 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 KRT83P78385 493 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SHC3Q92529 594 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SIX4Q9UIU6 781 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 TET1Q8NFU7 2136 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 PTPRJQ12913 1337 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 LRRC53A6NM62 1247 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 A8MXQ7 604 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 PAEPP09466 180 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 CDK17Q00537 523 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 LMO3Q8TAP4 145 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 DNAJC7Q99615 494 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.427e-8■■■□□ 16.3
CLSPN-202ENST00000318121 CISHQ9NSE2 258 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 MIOSQ9NXC5 875 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SPG21Q9NZD8 308 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SYN3O14994 580 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 TACC1O75410 805 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 DGKIO75912 1065 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 GJB5O95377 273 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SKILP12757 684 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 KLK7P49862 253 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 WNT7BP56706 349 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 DSC1Q08554 894 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SAMD11Q96NU1 681 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 CASD1Q96PB1 797 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 MSRAQ9UJ68 235 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 F8VZ95 297 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 ZSCAN12O43309 604 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 WEE2P0C1S8 567 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 VDRP11473 427 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 CLCNKBP51801 687 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 PTPN21Q16825 1174 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SUSD3Q96L08 255 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SIX2Q9NPC8 291 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 THAP12O43422 761 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 GNA15P30679 374 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 PRKCIP41743 596 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 CREMQ03060 361 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 RAB30Q15771 203 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 UPP1Q16831 310 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 SGO2Q562F6 1265 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF280DQ6N043 979 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 KIAA1328Q86T90 577 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 TC2NQ8N9U0 490 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 BAP1Q92560 729 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 NRP1O14786 923 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 CYP26A1O43174 497 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 NOL4O94818 638 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 GALTP07902 379 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 DESP17661 470 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 ITGB8P26012 769 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 BCAR1P56945 870 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 DEFB103AP81534 67 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 USP41Q3LFD5 358 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 GJB7Q6PEY0 223 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSPN-202ENST00000318121 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms