RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 TUSC3Q13454 348 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ABI1Q8IZP0 508 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SDCBP2Q9H190 292 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 PODXLO00592 558 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFAIP3P21580 790 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGB8P26012 769 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CLCNKBP51801 687 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CDH8P55286 799 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 LILRA4P59901 499 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 MFSD5Q6N075 450 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1328Q86T90 577 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM199Q8N511 208 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 UROC1Q96N76 676 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.135e-8■■□□□ 12.6
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXA2O43364 376 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CILPO75339 1184 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 GNA15P30679 374 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CDR2Q01850 454 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF677Q86XU0 584 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 NAGPAQ9UK23 515 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 SPTLC1O15269 473 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 VAV2P52735 878 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 INCA1Q0VD86 236 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 UPP1Q16831 310 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF394Q53GI3 561 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF3Q5VWG9 929 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ALPK3Q96L96 1907 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 LTBP2Q14767 1821 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PFKMP08237 780 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CSF2RAP15509 400 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 VWCEQ96DN2 955 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 MMEP08473 750 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEA1P43355 309 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 APPL2Q8NEU8 664 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 HUS1O60921 280 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CHRNB2P17787 502 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 FMO1Q01740 532 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 NENFQ9UMX5 172 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 THAP12O43422 761 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PAEPP09466 180 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0U1RQJ8 604 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 TACC1O75410 805 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 B3GAT3O94766 335 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CALCAP01258 141 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PAX3P23760 479 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 NDST1P52848 882 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 RAD23BP54727 409 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 DSC1Q08554 894 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF5AQ12840 1032 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 DPH6Q7L8W6 267 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PALB2Q86YC2 1186 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 WHAMMQ8TF30 809 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 L1RE1Q9UN81 338 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 EFCAB14O75071 495 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.09■■□□□ 1.13
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