RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 DPH6Q7L8W6 267 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 TMC7Q7Z402 723 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB123Q8N688 67 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 SEMA4DQ92854 862 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 B3GALT6Q96L58 329 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 GUCD1Q96NT3 240 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 NDST4Q9H3R1 872 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 PLXNA3P51805 1871 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 LRRN2O75325 713 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 OAZ2O95190 189 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 FAM163BP0C2L3 166 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 ATP1A3P13637 1013 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 CREMQ03060 361 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 CEP57Q86XR8 500 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 LMO3Q8TAP4 145 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 MTRRQ9UBK8 725 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 L1RE1Q9UN81 338 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.21□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D4O60343 1298 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 HUS1O60921 280 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 CXCL14O95715 111 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 P4HA1P13674 534 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 TNNC1P63316 161 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 TPM4P67936 248 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 PSMD5Q16401 504 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 FNIP2Q9P278 1114 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 HIDE1A8MVS5 230 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 H7C4K7 107 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 C2CD2LO14523 706 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 GABRDO14764 452 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 TACC1O75410 805 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 TPM2P07951 284 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 ASPAP45381 313 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 WDR44Q5JSH3 913 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 WSCD1Q658N2 575 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF280DQ6N043 979 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 GBP6Q6ZN66 633 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 METTL23Q86XA0 190 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 MYLIPQ8WY64 445 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 BCO2Q9BYV7 579 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 VPS16Q9H269 839 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 GCNT4Q9P109 453 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 POLIQ9UNA4 740 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 PTPRDP23468 1912 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 LGALS16A8MUM7 142 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 CSPG5O95196 566 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 C1RP00736 705 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CCDC42-201ENST00000293845 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms