RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRKCIP41743 596 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IKBKEQ14164 716 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM199Q8N511 208 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LTBP2Q14767 1821 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RCCD1A6NED2 376 aa25.53■■□□□ 1.68
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF5AQ12840 1032 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FERP16591 822 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRPAP1P30533 357 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.53■■□□□ 1.68
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBR7Q8N806 425 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAF4BQ92750 862 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.53■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM170AA1A519 330 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INPPL1O15357 1258 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANXA13P27216 316 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAGEA1P43355 309 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRIK3Q13003 919 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC35F6Q8N357 371 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASD1Q96PB1 797 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TFR2Q9UP52 801 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.52■■□□□ 1.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.51■■□□□ 1.67
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPHB4P54760 987 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEFB103AP81534 67 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTK2Q05397 1052 aa25.51■■□□□ 1.67
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF394Q53GI3 561 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.51■■□□□ 1.67
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MMS19Q96T76 1030 aa25.51■■□□□ 1.67
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CISHQ9NSE2 258 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D13Q9NVG8 400 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.51■■□□□ 1.67
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC18A3Q16572 532 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM270Q6UE05 265 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.51■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.51■■□□□ 1.67
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PJA2O43164 708 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNNC1P63316 161 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUSC3Q13454 348 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UPP1Q16831 310 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NPAS4Q8IUM7 802 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IL23AQ9NPF7 189 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KPNA7A9QM74 516 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITGB1P05556 798 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAF6P49848 677 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABI1Q8IZP0 508 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 URGCPQ8TCY9 931 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.49■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A087X0T9 212 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HCRTO43612 131 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC172P0C7W6 258 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM228BP0C875 321 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.48■■□□□ 1.67
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