RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.14■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.14■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.14■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 FADS3Q9Y5Q0 445 aa23.14■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 TLR2O60603 784 aa23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PDE5AO76074 875 aa23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PRR16Q569H4 304 aa23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 KLHL35Q6PF15 583 aa23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 TRIM50Q86XT4 487 aa23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.14■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ADM5C9JUS6 153 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CCDC22O60826 627 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 OPHN1O60890 802 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 GH1P01241 217 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CREB1P16220 341 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 NEK2P51955 445 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZNX1 250 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 TREML1Q86YW5 311 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 VILLO15195 856 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 MAGEB2O15479 319 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SREBF1P36956 1147 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 MPP2Q14168 576 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CEP72Q9P209 647 aa23.13■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 A0A087X0T9 212 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 A8MXQ7 604 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 E9PBE3 544 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 OR6B1O95007 311 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 FAM228BP0C875 321 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 RARGP13631 454 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ARFIP2P53365 341 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 BBS5Q8N3I7 341 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 FNBP1Q96RU3 617 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PARP2Q9UGN5 583 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SLC2A7Q6PXP3 512 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 DDX12PQ92771 950 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 BTBD10Q9BSF8 475 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 RRAGCQ9HB90 399 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 USP29Q9HBJ7 922 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 MYPNQ86TC9 1320 aa23.12■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 POTEB3A0JP26 581 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 E9PMD0 336 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PRKG1Q13976 671 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 POTEBQ6S5H4 581 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PALB2Q86YC2 1186 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PASD1Q8IV76 773 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 GSC2O15499 205 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ZWINTO95229 277 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 FOXN2P32314 431 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 VPS41P49754 854 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 HYIQ5T013 277 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 GRHL1Q9NZI5 618 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SNX24Q9Y343 169 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 WASF2Q9Y6W5 498 aa23.11■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CBFA2T3O75081 653 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 MED24O75448 989 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 BRAFP15056 766 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PEX26Q7Z412 305 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CROCCP3Q8IVE0 287 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CCDC162PA2VCL2 907 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CFBP00751 764 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 FGFR4P22455 802 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 DGKZQ13574 1117 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SULF1Q8IWU6 871 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms