RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 HVCN1Q96D96 273 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 BORCS6Q96GS4 357 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 C2CD2Q9Y426 696 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 PPEF2O14830 753 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 LAMTOR5O43504 91 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 VNN2O95498 520 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 NFICP08651 508 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 GRM2Q14416 872 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SV2BQ7L1I2 683 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 E2F7Q96AV8 911 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CLDN23Q96B33 292 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 DSEQ9UL01 958 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ASB3Q9Y575 518 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ANO9A1A5B4 782 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 MAN2B1O00754 1011 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 GJA1P17302 382 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SYT1P21579 422 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TEAD2Q15562 447 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SFR1Q86XK3 245 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR11A4FU01 709 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SPTLC1O15269 473 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CYP11A1P05108 521 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 GAP43P17677 238 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 GDI1P31150 447 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 VITQ6UXI7 678 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 METTL23Q86XA0 190 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC3Q9BY71 257 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 DPP3Q9NY33 737 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TISP43B9A030 160 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 VIPR2P41587 438 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TAF6P49848 677 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 RESTQ13127 1097 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP54Q96N23 3096 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CLIC6Q96NY7 704 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 COL4A3Q01955 1670 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 F5P12259 2224 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PRU2 124 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 MYMKA6NI61 221 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CYB561D2O14569 222 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF263O14978 683 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R37O75864 691 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 IL18RAPO95256 599 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 FGF19O95750 216 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ITIH5Q86UX2 942 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TMC8Q8IU68 726 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ACCSQ96QU6 501 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM209Q96SK2 561 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 STRA6Q9BX79 667 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 SCN1AP35498 2009 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 ANK1P16157 1881 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 KINO60870 393 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ADSSP30520 456 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SMARCB1Q12824 385 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 YAF2Q8IY57 180 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 PSMG2Q969U7 264 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms