RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 MTFR1Q15390 333 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TUBA1AQ71U36 451 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 FBF1Q8TES7 1133 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PLVAPQ9BX97 442 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 THAP2Q9H0W7 228 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ECT2Q9H8V3 914 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 POLD4Q9HCU8 107 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 NFASCO94856 1347 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TP73O15350 636 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TJP3O95049 919 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PTPN2P17706 415 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PCK1P35558 622 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PLTPP55058 493 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 OCRLQ01968 901 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 BFSP1Q12934 665 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 BOLA3Q53S33 107 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF398Q8TD17 642 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SLC5A5Q92911 643 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 AAASQ9NRG9 546 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SNX24Q9Y343 169 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PPME1Q9Y570 386 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PCNTO95613 3336 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 USP17L10C9JJH3 530 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TPBGLP0DKB5 382 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC142Q17RM4 750 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 IL23RQ5VWK5 629 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 STK32AQ8WU08 396 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 C18orf8Q96DM3 657 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF333Q96JL9 665 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 CCT7Q99832 543 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TLE6Q9H808 572 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PARVGQ9HBI0 331 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 GCNT3O95395 438 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ASMTLO95671 621 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 GSTT2P0CG29 244 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 GSTT2BP0CG30 244 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SKIP12755 728 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 EMP3P54852 163 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 KCNJ2P63252 427 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 STRN3Q13033 797 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TRIM50Q86XT4 487 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SNF8Q96H20 258 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 OLFM3Q96PB7 478 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 HGH1Q9BTY7 390 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 AMNQ9BXJ7 453 aa6.65□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms