RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172417.2

Usf2-211, Transcript of Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Usf2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2-211ENSMUST00000172417 Ap3m2Q8R2R9 418 aa21.43■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Tom1l1Q923U0 474 aa21.43■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Dusp10Q9ESS0 483 aa21.43■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Tmem215A7E1Z1 235 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 9330159F19RikD3Z623 648 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Gdf7P43029 461 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Tnnt2P50752 301 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 PtpaP58389 323 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Dlg4Q62108 724 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Crybg3Q80W49 1005 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 SucoQ8C341 1250 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Slfn5Q8CBA2 884 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Timd2Q8R183 305 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 CalcbQ99MP3 130 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Tspan3Q9QY33 253 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 DexiQ9WUQ7 95 aa21.42■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Cypt3B1AY64 174 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Vmn2r63E9Q0K5 859 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Gm9268E9Q0M3 861 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Gm1661E9Q963 441 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Vmn2r62K7N712 859 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Gm5571P01639 130 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Shmt1P50431 478 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Olfr1105Q7TR58 312 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Prss50Q8BLH5 439 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Q8C4P0 716 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Pcdhb18Q91Y02 792 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 MrgpreQ91ZB7 310 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Gstt4Q9D4P7 240 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Ascl3Q9JJR7 174 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 PdcQ9QW08 244 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Uchl5Q9WUP7 329 aa21.41■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 4933406M09RikG3XA12 479 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Aff1O88573 1216 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Gna14P30677 355 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 SpoplQ2M2N2 392 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Ltbp3Q61810 1268 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Tmem164Q6PHN7 296 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Zfp512bQ6PHP4 879 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Otop2Q80SX5 563 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Rspry1Q8BVR6 576 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Fbxl13Q8CDU4 790 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Gga1Q8R0H9 635 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Ces1fQ91WU0 561 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Sfxn1Q99JR1 322 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Cfap53Q9D439 514 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Atad1Q9D5T0 361 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Lman2Q9DBH5 358 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Rfx5Q9JL61 658 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa21.4■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Atg2aQ6P4T0 1914 aa21.39■■□□□ 1.02
Usf2-211ENSMUST00000172417 Pate1E9Q658 125 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Sema4dO09126 861 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 RaxO35602 342 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Mllt10O54826 1068 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Pla2g4cQ64GA5 597 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Prmt8Q6PAK3 394 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Ints8Q80V86 995 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Cct8l1Q80YT3 562 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Rhpn2Q8BWR8 686 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Slc22a17Q9D9E0 401 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Pdzd4Q9QY39 772 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Trpc3Q9QZC1 836 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Vwa8Q8CC88 1905 aa21.39■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Prl2c2P04095 224 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Zfp1P08042 402 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 PtgdrP70263 357 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Hook1Q8BIL5 728 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Lig4Q8BTF7 911 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Fam163bQ8BUM6 167 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Pyhin1Q8BV49 420 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Robo4Q8C310 1012 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Zbtb6Q8K088 423 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Pop1Q8K205 1045 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Pebp4Q9D9G2 242 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Smg9Q9DB90 520 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Rilpl1Q9JJC6 406 aa21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 CitP49025 2055 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 A0A1L1SQF0 893 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Usp35M0QWN7 1009 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Cetn3O35648 167 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Serac1Q3U213 654 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 4933416C03RikQ3V063 378 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Tsg101Q61187 391 aa21.37■■□□□ 1.01
Usf2-211ENSMUST00000172417 Rnf139Q7TMV1 668 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.3 ms