RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dupd1Q8BK84 215 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp26Q99MX1 835 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Satl1Q9D5N8 744 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcb11Q9QY30 1321 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psme4Q5SSW2 1843 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bfsp1A2AMT1 669 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lonrf1D3YY23 762 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc6D3YZP9 469 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4758L7N258 96 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NumblO08919 604 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AgxtO35423 414 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Birc5O70201 140 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FerP70451 823 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde1bQ01065 535 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plk1Q07832 603 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb14Q08376 449 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4933427I04RikQ3V053 235 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ece1Q4PZA2 769 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc10a5Q5PT54 434 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sestd1Q80UK0 696 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slitrk1Q810C1 696 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc39a13Q8BZH0 361 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdm1bQ8CIG3 826 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lin7aQ8JZS0 233 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde6cQ91ZQ1 861 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rev1Q920Q2 1249 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 St13Q99L47 371 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Isl2Q9CXV0 359 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IydQ9DCX8 285 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klf15Q9EPW2 415 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnq4Q9JK97 696 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 XkQ9QXY7 446 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zgrf1Q0VGT4 1863 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TroapB7ZNG4 668 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TazI7HJS2 263 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 InhbeO08717 350 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp8O09112 663 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chil3O35744 398 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rtn2O70622 471 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AfmO89020 608 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sstr1P30873 391 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myl2P51667 166 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmc5P62196 406 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serping1P97290 504 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Togaram2Q3TYG6 1002 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Garnl3Q3V0G7 1038 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mea1Q64327 174 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AmphQ7TQF7 686 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem145Q8C4U2 746 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 N4bp3Q8C7U1 537 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4921504E06RikQ8CET2 560 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ClasrpQ8CFC7 668 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tph2Q8CGV2 488 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Haus3Q8QZX2 570 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snap47Q8R570 413 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plekhh3Q8VCE9 796 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ivns1abpQ920Q8 642 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rex1bdQ9CYZ6 169 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem68Q9D850 329 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tjp3Q9QXY1 905 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf25Q9QZR0 456 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PodxlQ9R0M4 503 aa6.96□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B020011L13RikA0A087WQI7 412 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap42B2RQE8 841 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm15448F6PZL4 682 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xbp1O35426 267 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csf1rP09581 977 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phka1P18826 1241 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VdrP48281 422 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbp3P49194 1234 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad54lP70270 747 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VegfaQ00731 214 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnc2Q14B80 642 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eepd1Q3TGW2 569 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dsg1aQ61495 1057 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capn3Q64691 821 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ripor1Q68FE6 1223 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pak4Q8BTW9 593 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EtnpplQ8BWU8 499 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Osbpl2Q8BX94 484 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defb15Q8R2I5 79 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf445Q8R2V3 986 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef25Q9CWR0 618 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf14Q9JI90 485 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdzd4Q9QY39 772 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 208.9 ms