RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637667.1

CLN6-222, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLN6, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-222ENST00000637667 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 ELMOD1Q8N336 334 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 MTMR6Q9Y217 621 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 OR6C75A6NL08 312 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 TISP43B9A030 160 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 ECI2O75521 394 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 NFICP08651 508 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 TYMPP19971 482 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 ACOT2P49753 483 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 PFKPQ01813 784 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 TWF1Q12792 350 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 ADALQ6DHV7 355 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 IQCEQ6IPM2 695 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 HVCN1Q96D96 273 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 BACH2Q9BYV9 841 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 FOXQ1Q9C009 403 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 CEP72Q9P209 647 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 DERAQ9Y315 318 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 MYMKA6NI61 221 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 MICAL2O94851 1124 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 OR4Q2P0C623 313 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 CCR2P41597 374 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 LILRA4P59901 499 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 SV2BQ7L1I2 683 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 PJA1Q8NG27 643 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 USP28Q96RU2 1077 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 ASB7Q9H672 318 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 YIPF1Q9Y548 306 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 USP34Q70CQ2 3546 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 F5P12259 2224 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 PPP1R37O75864 691 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 VNN2O95498 520 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 GAP43P17677 238 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 PAX3P23760 479 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 PRKCQQ04759 706 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 SLC39A14Q15043 492 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 DNAJC19Q96DA6 116 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 SENP8Q96LD8 212 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 C2CD2Q9Y426 696 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN6-222ENST00000637667 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 ANO9A1A5B4 782 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 PRR23AA6NEV1 266 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 PIRO00625 290 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 SPTLC1O15269 473 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 ODC1P11926 461 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 EPHA5P54756 1037 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 GPR17Q13304 367 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 MYBPC2Q14324 1141 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 POSTNQ15063 836 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 LEMD2Q8NC56 503 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 STRA6Q9BX79 667 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 ASAH2Q9NR71 780 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 STX6O43752 255 aa21.75■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 MYL4P12829 197 aa21.75■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 FCARP24071 287 aa21.75■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 ADSSP30520 456 aa21.75■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 STAT6P42226 847 aa21.75■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 DUSP4Q13115 394 aa21.75■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 ASB16Q96NS5 453 aa21.75■■□□□ 1.07
CLN6-222ENST00000637667 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms