RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	USP17L5	A8MUK1	530 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PYGB	P11216	843 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PWWP2A	Q96N64	755 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	GRM4	Q14833	912 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	GEN1	Q17RS7	908 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	RNF43	Q68DV7	783 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	DUPD1	Q68J44	220 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	TLCD1	Q96CP7	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	CCT7	Q99832	543 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	CES2	O00748	559 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ART3	Q13508	389 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	RASA2	Q15283	850 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	HIF1A	Q16665	826 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	SESTD1	Q86VW0	696 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	LRRC6	Q86X45	466 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	CALN1	Q9BXU9	219 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	CD209	Q9NNX6	404 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ZBBX	A8MT70	800 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ABLIM1	O14639	778 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	MCF2L	O15068	1137 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	MCF2	P10911	925 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	FMO5	P49326	533 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	EMSY	Q7Z589	1322 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	FOXP2	O15409	715 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	KDM1A	O60341	852 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PYGM	P11217	842 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	AOC3	Q16853	763 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	SERPINI1	Q99574	410 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	LY75	O60449	1722 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	GAP43	P17677	238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	IGBP1	P78318	339 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	HAUS8	Q9BT25	410 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PIAS1	O75925	651 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ANXA13	P27216	316 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	GALK1	P51570	392 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	C2CD6	Q53TS8	623 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PDXK	O00764	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	SLC37A4	O43826	429 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	SERPINB8	P50452	374 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ACAP1	Q15027	740 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	PARP6	Q2NL67	630 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624		A0A1B0GVG6	124 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PXN-222	ENST00000637624	FCHO1	O14526	889 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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