RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622090.4

DDB2-215, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, human

TSL 5

Gene DDB2, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB2-215	ENST00000622090	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TAF4	O00268	1085 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	LIG1	P18858	919 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CEP120	Q8N960	986 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	KCNB2	Q92953	911 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	DEXI	O95424	95 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PRAMEF12	O95522	483 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	EVC	P57679	992 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CREB5	Q02930	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	UROC1	Q96N76	676 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	HHIP	Q96QV1	700 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PI4KA	P42356	2102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ACKR2	O00590	384 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PODXL	O00592	558 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	WNT7A	O00755	349 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	SYN3	O14994	580 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	MARCH6	O60337	910 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	AKAP3	O75969	853 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	CAVIN2	O95810	425 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	MAPK6	Q16659	721 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090		H7C4K7	107 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	RNF40	O75150	1001 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	EGF	P01133	1207 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	CEACAM1	P13688	526 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	OSTN	P61366	133 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DDB2-215	ENST00000622090	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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