RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 RPN1P04843 607 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ZNF280DQ6N043 979 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 NR2E1Q9Y466 385 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ZNF233A6NK53 670 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 OAZ2O95190 189 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 PRR29P0C7W0 189 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 LIN9Q5TKA1 542 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 RTL10Q7L3V2 364 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 CBWD2Q8IUF1 395 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ZNF461Q8TAF7 563 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 PRKD2Q9BZL6 878 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 PDE11AQ9HCR9 933 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 FBXL5Q9UKA1 691 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 PI4K2BG5E9Z4 385 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 RHOBTB3O94955 611 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 TYMPP19971 482 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 HOXA9P31269 272 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ROR1Q01973 937 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 SURF1Q15526 300 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 UVSSAQ2YD98 709 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 DSTYKQ6XUX3 929 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 RNF135Q8IUD6 432 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 USTQ9Y2C2 406 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 CLIC2O15247 247 aa26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 SPTLC1O15269 473 aa26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ABLIM3O94929 683 aa26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 XXYLT1Q8NBI6 393 aa26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA5Q8TBA6 731 aa26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 SENP8Q96LD8 212 aa26.9■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 WDR27A2RRH5 827 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 C8AP07357 584 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ALADP13716 330 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 TAF6P49848 677 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 KCNB1Q14721 858 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 TMEM174Q8WUU8 243 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 NOTCH4Q99466 2003 aa26.89■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 POU2F2P09086 479 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ODC1P11926 461 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 TPGS2Q68CL5 300 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 USP37Q86T82 979 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CXorf38Q8TB03 319 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ZNF560Q96MR9 790 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ITGA11Q9UKX5 1188 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 DCXO43602 365 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CYP11A1P05108 521 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ATF2P15336 505 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 PNPLA4P41247 253 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CYP2J2P51589 502 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 PPM1LQ5SGD2 360 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 SLC7A14Q8TBB6 771 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 KCTD10Q9H3F6 313 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 EPHX3Q9H6B9 360 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 INTS13Q9NVM9 706 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 C2CD4DB7Z1M9 353 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 SV2CQ496J9 727 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 OVOS1Q6IE37 1185 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 BORCS6Q96GS4 357 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 DSEQ9UL01 958 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 MAFFQ9ULX9 164 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CLUHO75153 1309 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 OR6C75A6NL08 312 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 PDXKO00764 312 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 KIF20AO95235 890 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ITGB3P05106 788 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 SLC9A9Q8IVB4 645 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 TCEAL8Q8IYN2 117 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 LRRC52Q8N7C0 313 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 TIGD1Q96MW7 591 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 MTMR12Q9C0I1 747 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 PIDD1Q9HB75 910 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 TECTAO75443 2155 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 PTPRJQ12913 1337 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 KPNA7A9QM74 516 aa26.85■■□□□ 1.89
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