RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC26A4O43511 780 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 OAZ2O95190 189 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 VNN2O95498 520 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR4Q2P0C623 313 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP3A5P20815 502 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 UBA7P41226 1012 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 GRIN1Q05586 938 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYCT1Q8N699 235 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 BEST2Q8NFU1 509 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNASE1L2Q92874 299 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 YIPF1Q9Y548 306 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPEF2O14830 753 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 LAMTOR5O43504 91 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM13AO94988 1023 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 PIGRP01833 764 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYL4P12829 197 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 GJA1P17302 382 aa22.59■■□□□ 1.21
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ID4P47928 161 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF131P52739 623 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPHA5P54756 1037 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 PARVGQ9HBI0 331 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 ASAH2Q9NR71 780 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 OGTO15294 1046 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLCG1P19174 1290 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 MCM6Q14566 821 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 KYAT1Q16773 422 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 VITQ6UXI7 678 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 LEMD2Q8NC56 503 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAD54LQ92698 747 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMARCD2Q92925 531 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLDN23Q96B33 292 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 NELL2Q99435 816 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 BRD9Q9H8M2 597 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-208ENST00000616074 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRAK2O60296 914 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADRB2P07550 413 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 FZD5Q13467 585 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP37Q86T82 979 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 FIZ1Q96SL8 496 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 NCANO14594 1321 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A0B4J269 797 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR6C75A6NL08 312 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 NCAM2O15394 837 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 KINO60870 393 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCP2P22307 547 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 VIPR2P41587 438 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 MCM2P49736 904 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXK2Q01167 660 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 TEAD2Q15562 447 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPATA1Q5VX52 437 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 JADE1Q6IE81 842 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM212AQ96EL1 285 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 HINFPQ9BQA5 517 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 BMP15O95972 392 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSMC3P17980 439 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 TYMPP19971 482 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 GDI1P31150 447 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 DUSP4Q13115 394 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR17Q13304 367 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMC8Q8IU68 726 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 IRF7Q92985 503 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-208ENST00000616074 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.55■■□□□ 1.2
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