RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 GALCP54803 685 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 DPP3Q9NY33 737 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 KLK14Q9P0G3 267 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 NCAM1P13591 858 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PDIA6Q15084 440 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 P4HA2O15460 535 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 HAUS5O94927 633 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ARFIP2P53365 341 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PCSK7Q16549 785 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 UGP2Q16851 508 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TBX20Q9UMR3 447 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 FOXP2O15409 715 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 MSH4O15457 936 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TADA3O75528 432 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 GTF2H1P32780 548 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PDK1Q15118 436 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PGK2P07205 417 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V1E1P36543 226 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 E2F5Q15329 346 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRN2Q92932 1015 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ADA2Q9NZK5 511 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRMP28827 1452 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ATP5HO75947 161 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CYP11B2P19099 503 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R2AP63151 447 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PDCLQ13371 301 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 RRM2BQ7LG56 351 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SENP2Q9HC62 589 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 LATS2Q9NRM7 1088 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF677Q86XU0 584 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CEP19Q96LK0 163 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP99D6REC4 459 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 AMACRQ9UHK6 382 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CPA4Q9UI42 421 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 GCKP35557 465 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 STAT4Q14765 748 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 MAPRE2Q15555 327 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 OPTNQ96CV9 577 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 GGCXP38435 758 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CDH18Q13634 790 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 H0Y626 953 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 SEPT8Q92599 483 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 ETFBP38117 255 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 TRADDQ15628 312 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CD302Q8IX05 232 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 CPS1P31327 1500 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GTH6 734 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-208ENST00000613122 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms