RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM237Q96Q45 408 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM51Q9NW97 253 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ITIH2P19823 946 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TYK2P29597 1187 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NIM1KQ8IY84 436 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RTN2O75298 545 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RPN2P04844 631 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC189A1A4V9 331 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MPOP05164 745 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FGFR4P22455 802 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 IRAK1P51617 712 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ARSEP51690 589 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 EVPLLA8MZ36 301 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DPYDQ12882 1025 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AP3B2Q13367 1082 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RCN1Q15293 331 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KDM7AQ6ZMT4 941 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLITRK2Q9H156 845 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MED26O95402 600 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TTKP33981 857 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TRIQKQ629K1 86 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DDIASQ8IXT1 998 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 BFARQ9NZS9 450 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 S100A6P06703 90 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 COPB2P35606 906 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NPY2RP49146 381 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KYNUQ16719 465 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 THTPAQ9BU02 230 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL3Q9UH77 587 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 BTDP43251 543 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 STARD8Q92502 1023 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CEP170P1Q96L14 293 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZFATQ9P243 1243 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 O00370 1275 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GHRP10912 638 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 OSBPP22059 807 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 BCAMP50895 628 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF699Q32M78 642 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NLRP10Q86W26 655 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ERP27Q96DN0 273 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MTA3Q9BTC8 594 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WWV3 80 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GTH6 734 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H2ADP20671 130 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NECTIN1Q15223 517 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM167AQ96KS9 214 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RGS18Q9NS28 235 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DTNAQ9Y4J8 743 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.29□□□□□ -1.24
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