RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 CEP72Q9P209 647 aa12.91□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 DNMT3LQ9UJW3 386 aa12.91□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 PILRBQ9UKJ0 227 aa12.91□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa12.91□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 FLNCQ14315 2725 aa12.91□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 PTPRDP23468 1912 aa12.91□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 GON4LQ3T8J9 2241 aa12.9□□□□□ -0.34
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HCG18-241ENST00000602290 TSPAN1O60635 241 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 SEC24AO95486 1093 aa12.9□□□□□ -0.34
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HCG18-241ENST00000602290 CLK2P49760 499 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
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HCG18-241ENST00000602290 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
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HCG18-241ENST00000602290 CYP4A22Q5TCH4 519 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.9□□□□□ -0.34
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HCG18-241ENST00000602290 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 SH2D3AQ9BRG2 576 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 DSCC1Q9BVC3 393 aa12.9□□□□□ -0.34
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HCG18-241ENST00000602290 SEMA4CQ9C0C4 833 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 GPR88Q9GZN0 384 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 RIC8AQ9NPQ8 531 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 DISC1Q9NRI5 854 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 MYO16Q9Y6X6 1858 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 ERVH48-1M5A8F1 160 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 CTIFO43310 598 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 CYP3A4P08684 503 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 AKAP5P24588 427 aa12.89□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 CSRP3P50461 194 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 PLCB2Q00722 1185 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 SLC14A1Q13336 389 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa12.89□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 STXBP5Q5T5C0 1151 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 NOTUMQ6P988 496 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 HAUS6Q7Z4H7 955 aa12.89□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 CATIPQ7Z7H3 387 aa12.89□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.89□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 CSRNP2Q9H175 543 aa12.89□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa12.88□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 PTGESO14684 152 aa12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 DDAH1O94760 285 aa12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 SERPINF2P08697 491 aa12.88□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 TKTP29401 623 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 ARMCX6Q7L4S7 300 aa12.88□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 MDGA1Q8NFP4 955 aa12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 TSTD1Q8NFU3 115 aa12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.88□□□□□ -0.35
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HCG18-241ENST00000602290 SLC6A14Q9UN76 642 aa12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 SAMM50Q9Y512 469 aa12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.88□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 PRAMEF12O95522 483 aa12.87□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 MBD3O95983 291 aa12.87□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 CFIP05156 583 aa12.87□□□□□ -0.35
HCG18-241ENST00000602290 PRKCBP05771 671 aa12.87□□□□□ -0.35
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