RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TNNC2	P02585	160 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	IGFBP4	P22692	258 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GCLM	P48507	274 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	MYL6	P60660	151 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	RBP5	P82980	135 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PTPRD	P23468	1912 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ADAM12	O43184	909 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CXCL14	O95715	111 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	KRT13	P13646	458 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	FOSL2	P15408	326 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GLUD2	P49448	558 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TAF6	P49848	677 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	AP3M2	P53677	418 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.49	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SYN3	O14994	580 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	KRT19	P08727	400 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PYGB	P11216	843 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GTF2H1	P32780	548 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	HYAL1	Q12794	435 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	KCNC3	Q14003	757 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	C2CD2L	O14523	706 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PER2	O15055	1255 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TEX28	O15482	410 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	OAZ2	O95190	189 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GNA14	O95837	355 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CYP11A1	P05108	521 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	UROD	P06132	367 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TYMP	P19971	482 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PAX3	P23760	479 aa		13.47	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PNPLA4	P41247	253 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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