RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CGRRF1Q99675 332 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS18Q9NS28 235 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP350Q5VT06 3117 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 COL4A6Q14031 1691 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GTH6 734 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC26A0AVF1 554 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBBXA8MT70 800 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LGALS16A8MUM7 142 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CLSTN1O94985 981 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 VNN1O95497 513 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CAVIN2O95810 425 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CALCAP01258 141 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TNNI1P19237 187 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 AXLP30530 894 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FMO5P49326 533 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL7Q01449 175 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FPGSQ05932 587 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 BIRC3Q13489 604 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NR1I3Q14994 352 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SYCP1Q15431 976 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 UVSSAQ2YD98 709 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF365Q70YC5 407 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMC6Q7Z403 805 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM114A1Q8IWE2 563 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NDST4Q9H3R1 872 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CHST12Q9NRB3 414 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 POLIQ9UNA4 740 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SQORQ9Y6N5 450 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CITO14578 2027 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL5CA6NH57 179 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 I3L4J1 428 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PHACTR2O75167 634 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 OFD1O75665 1012 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DDHD2O94830 711 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CSPG5O95196 566 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 HLA-DRAP01903 254 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB3P05106 788 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT19P08727 400 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCD1P33897 745 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PBX3P40426 434 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3CAP42336 1068 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RAP1GAPP47736 663 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MRE11P49959 708 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MXI1P50539 228 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL6P60660 151 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 IKBKEQ14164 716 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MYBPC2Q14324 1141 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SARM1Q6SZW1 724 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRED2Q7Z698 418 aa6.51□□□□□ -1.37
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